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互作与验证

互作组学与多组学

从体内验证(Co-IP、BiFC)到体外结合(GST-Pull down、MST、SPR)以及转录调控(ChIP-seq、EMSA、双荧光素酶)的全套互作组学技术方案,助力课题组一站式攻克作用机制验证难关。

Co-IP / BiFCChIP-seq / CUT&TagMST / SPRCRISPR/Cas9
互作组学检测

互作组学 (Co-IP / ChIP)

在蛋白质翻译后修饰(PTM)或差异表达分析后,深入探究“蛋白质-蛋白质”、“蛋白质-DNA/RNA”以及“蛋白质-小分子”的相互作用是解析生命调控机制的必经之路。速帛科技整合了从体内验证到体外结合以及转录调控的全套互作组学技术方案。

我们的优势

  • 01

    全谱系验证能力:提供包括微量热电泳 (MST)、表面等离子共鸣 (SPR) 等前沿亲和力测定,以及经典的酵母双杂交、DAP-seq 等筛库服务。

  • 02

    严格的对照设置:每个项目均配备 IgG 阴性对照或 Input 对照,确保特异性结合,拒绝假阳性。

  • 03

    专家级项目设计:由经验丰富的博士团队针对您的靶标蛋白进行抗体评估、载体构建方案设计,最大化实验成功率。

核心互作检测项目

检测层次具体检测技术应用场景
蛋白-蛋白互作 (PPI)Co-IP(共免疫共沉淀), GST-pulldown(体外拉下), BiFC(双分子荧光互补), 膜/核酵母双杂交 (Y2H)确认体内外直接结合,筛选或验证与靶修饰蛋白相互作用的辅助因子或修饰酶。
蛋白-DNA/RNA 互作ChIP-seq(染色质免疫共沉淀测序), CUT&Tag(靶向解离与转座酶测序), DAP-seq(DNA 亲和纯化测序), EMSA(凝胶迁移), 双荧光素酶报告基因探究转录因子或修饰酶在全基因组上的结合靶位点,验证转录调控活性。
分子亲和力测定MST(微量热电泳), SPR(表面等离子共鸣)测定蛋白质与蛋白质、多肽、RNA、小分子(如天然产物、药物)的结合常数 (KD 值)。

标准实验流程与交付成果

以经典的 Co-IP / Western Blot 验证流程为例:

  • 01

    抗体验证与转染:验证目的抗体特异性,若无合适特异性抗体,则构建带 Tag(如 Flag/HA/Myc)的真核表达质粒转染细胞。

  • 02

    细胞裂解与免疫沉淀:温和裂解细胞,加入特异性抗体及 Protein A/G 磁珠,于 4°C 孵育过夜富集复合物。

  • 03

    洗脱与检测:高纯度洗脱液洗脱,进行 SDS-PAGE 电泳及 Western Blot 检测,分析是否存在共沉淀条带。

交付成果:提供质检胶图、完整 WB 显色大图(包含对照组、Input 组、IgG 组和 IP 组)、以及包含试剂仪器与详细参数的规范实验报告,方便直接撰写论文。

多组学与基因验证

多组学联检与基因验证

单一维度的组学数据往往只能看到生命活动的冰山一角。速帛科技基因验证事业部推出“多组学关联与基因验证服务”。通过将“蛋白质修饰组”与“转录组(RNA-seq)”或“常规蛋白质组”进行联合分析,锁定候选通路,并依托成熟的 CRISPR/Cas9 基因编辑、shRNA 干扰、过表达等基因验证手段,在细胞或组织水平完成“基因敲除-组学变化-表型回复”的一站式全链路闭环验证。

平台优势

  • 01

    干湿实验闭环:干实验算法团队负责多维数据关联与网络重构,湿实验团队负责质粒构建、转染、敲除及下游表型检测。

  • 02

    数据真实可溯:所有数据由仪器直接产出,软件运行日志及原始凝胶孔位图 100% 留存,保障科研数据的真实客观与严谨性。

  • 03

    学术发表导向:直接契合中科院一区/Top 期刊对“高通量组学筛选 + 机制验证”的标准论文逻辑链,加速文章录用。

多组学关联分析内容

  • 01

    修饰组 & 蛋白质组关联:区分修饰水平的改变是由于“修饰酶活性/丰度变化”引起的,还是由于“蛋白自身丰度发生改变”引起的。通过对两组数据的九象限图(Nine Quadrants Plot)分析,精确筛选出真正的修饰变化底物。

  • 02

    修饰组 & 转录组关联:将表观遗传修饰、组蛋白修饰(如乳酸化、巴豆酰化)或者转录因子修饰丰度,与下游靶基因转录丰度(RNA-seq count)进行关联,绘制调控通路网络图,解释基因转录调控网络。

  • 03

    通路重叠与一致性分析:对不同组学的差异基因/蛋白进行 GO/KEGG 共富集(Co-enrichment)分析,筛选两条或多条组学共同激活的下游通路,绘制交互机制通路图。

细胞与基因水平闭环验证

为满足审稿人对“基因功能和生物学表型验证”的刚性要求,我们提供以下精准验证服务:

  • 01

    表型干扰与过表达:构建高效特异性 shRNA 干扰慢病毒或过表达质粒,对候选修饰酶或靶蛋白进行表达调控。

  • 02

    精准基因编辑:利用 CRISPR/Cas9 技术在候选细胞株(如 HeLa, RAW264.7 等)中构建靶基因敲除(KO)或定点突变(KI,如突变修饰 Lys 位点以防修饰发生)稳定株。

  • 03

    表型回复 (Rescue) 实验:在敲除株中回补野生型(WT)蛋白或修饰位点突变型(MUT)蛋白,观察是否能挽救表型变化(如增殖、凋亡、迁移或代谢产率)。

  • 04

    一站式表型检测:提供 CCK-8、流式细胞术(凋亡/周期)、Transwell(侵袭/迁移)、qPCR/WB 检测,协助获得最关键的表型证据。

病毒包装与载体

AAV 与慢病毒包装

在体内与体外开展蛋白质功能研究、相互作用验证或基因编辑时,高效的基因递送载体是成功的关键。速帛科技提供专业的慢病毒(Lentivirus)和腺相关病毒(AAV)包装服务,广泛应用于基因过表达、小干扰 RNA(shRNA)干扰、稳定细胞系筛选、体内示踪、神经科学以及动物疾病模型的建立。

腺相关病毒组合大促销

高滴度 AAV 包装结合下游分子互作检测(Co-IP/ChIP-seq 等),一站式闭环验证,立享超值组合优惠价!详情请联系颜经理:18910397181

  • 01

    基因治疗与药物研发:递送靶向基因进行疾病干预,提供高纯度临床前级别病毒。

  • 02

    体内示踪与基因编辑:结合荧光标记蛋白(EGFP/mCherry/Luciferase)或 CRISPR/Cas9 系统,实现细胞与组织水平的精准编辑与动态追踪。

  • 03

    神经科学与疾病模型:利用 AAV 特异性血清型跨越血脑屏障,对脑区神经元进行特异性标记与靶向调控。

AAV 与慢病毒包装技术指标

速帛科技采用优化的多质粒共转染包装系统,确保产出病毒具有高滴度、高纯度和极低的免疫原性:

技术指标腺相关病毒 (AAV)慢病毒 (Lentivirus)
病毒滴度高滴度包装:≥ 1E+13 vg/mL常规包装:≥ 1E+8 TU/mL,超浓缩型:≥ 1E+9 TU/mL
血清型选择AAV1, AAV2, AAV5, AAV6, AAV8, AAV9, AAV-DJ, PHP.eB 等多样化血清型VSV-G 伪分型(广谱宿主感染)
病毒纯度高纯度:实心率(Full Capsid)≥ 90%,经碘克沙醇超速离心纯化经超速离心及超滤纯化,低内毒素,适用于体内注射
定制化服务组织特异性启动子可选(如 Syn, GfaD, CamKII 等)、诱导表达、可控包装容量过表达载体构建、双启动子系统、四环素诱导(Tet-on/off)表达系统

体内 / 体外互作与功能验证

  • 01

    分子互作验证:结合 ChIP-qPCR、ChIP-seq、Co-IP、MST、SPR 等技术,确认基因过表达或敲低后分子水平的直接结合或修饰改变。

  • 02

    ChIP-qPCR 与 ChIP-seq 验证标准:ChIP-qPCR 提供特异性抗体富集、待测基因信息分析、完整的 qPCR 曲线及结果报告、所有原始胶图及数据;ChIP-seq 进行高通量测序分析、富集峰(Peak)召唤与注释、结合 Motif 分析、高通量测序实验报告及原始图片交付。

  • 03

    筛选与设计:提供千亿级抗体库筛选、SPR 分子亲和力垂钓、分子对接以及基因突变株(例如蛋白质 Lys 修饰位点突变)功能验证。

高通量测序

常规高通量测序

除了蛋白质翻译后修饰核心服务外,速帛科技亦拥有完善的核酸测序服务体系。依托 Illumina 新型高通量测序仪与 DNBSeq 平台,提供包括常规真核/原核转录组测序、重测序、宏基因组测序以及前沿的单细胞多组学及空间转录组服务。

我们的保障

  • 01

    高数据质量:碱基质量值 Q30 ≥ 85-90%,确保测序准确度,支持免费重测或补数。

  • 02

    快速的交付周期:转录组自收样到交付报告一般仅需 10-15 个工作日,大大缩短课题等待时间。

  • 03

    专家级生信报告:包含火山图、聚类热图、GO/KEGG 富集图及交互式 HTML 报告。

常规高通量测序项目

测序类型推荐配置与深度交付内容与生信分析
真核转录组测序 (RNA-seq)PE150, ≥ 6 Gb 清洁数据 / 样本差异表达基因分析 (DEG)、火山图、聚类热图、GO/KEGG 功能富集。
全基因组重测序 (WGS)PE150, ≥ 30X 覆盖深度SNP/InDel 变异检测、全基因组变异分布、SV/CNV 分析、群体进化。
微生物宏基因组 (Metagenomics)PE150, ≥ 10 Gb 数据 / 样本物种丰度剖面、基因功能注释 (CAZy, EggNOG)、耐药基因 (ARG) 与代谢通路。

单细胞多组学与空间组学前沿服务

针对肿瘤免疫微环境、器官发育与神经退行性疾病等需要高空间分辨率的研究,速帛科技提供:

  • 01

    单细胞 RNA-seq (scRNA-seq):基于 10x Genomics 平台,实现数万个单细胞的高通量捕获与测序,解析组织中的异质性、细胞亚群比例及拟时序分化轨迹。

  • 02

    空间转录组测序 (Stereo-seq / Visium):将基因表达与空间原位坐标相融合,在保持组织空间结构的同时获取全转录组信息,深入探索细胞-细胞间的空间互作邻近关系。

  • 03

    单细胞微生物组:针对复杂微生态,提供单个微生物的抓取与测序,突破“不可培养微生物”的基因组拼接技术瓶颈。